Originariamente, la Banca Accademica, quello che oggi chiamiamo Presidenza, era formata da un Principe ovvero il Presidente, da due Consiglieri, dal Sindaco e da due Censori, che più tardi divennero quattro. I soci, chiamati Ricovrati, erano divisi in benemeriti, aggiunti e ordinari.
In un primo momento le riunioni degli accademici erano strettamente private, successivamente divennero pubbliche e iniziarono ad accogliere le maggiori autorità cittadine. I soci sceglievano un argomento di dibattito su cui discutere in sede di adunanza che solitamente era accompagnata da esibizioni musicali. A partire dal 1735, l’Accademia ospitò una volta al mese delle adunanze di letterario esercizio. Dal 1750 si stabilì di alternare temi letterari e scientifici.
Nel 1779 il Senato Veneto ordinò la fusione dell’Accademia dei Ricovrati con quella di Arte Agraria; nacque così l’Accademia di Scienze, Lettere ed Arti.
Tuttavia, la caduta della Repubblica Veneta nel 1797 rallentò l’attività dell’Accademia, a causa della complessa situazione politica e dell’allontanamento di alcuni membri. L’Accademia perse così anche il sostegno economico proveniente dalla Serenissima.
Nel 1867, l’Accademia ottenne il riconoscimento di istituzione culturale da parte del Regno d’Italia, divenendo così Reale Accademia di scienze, lettere ed arti.
Nel primo Novecento, l’Accademia attraversò un periodo di difficoltà economiche, aggravato dalle restrizioni del regime fascista e dalle imposizioni razziali.
Inoltre durante il periodo bellico i bombardamenti danneggiarono gravemente la sede.
Nel secondo dopoguerra furono acquisiti alcuni locali sottostanti le sale accademiche e fu effettuato un radicale restauro di tutto il complesso edilizio e degli affreschi del Guariento.
